"O Imoralista" aborda de maneira profunda o conflito entre o desejo individual e as restrições sociais. Michel representa a busca pela autenticidade e a rejeição das convenções sociais, mas essa busca é acompanhada por uma sensação de vazio e de alienação. Gide questiona se a liberdade individual, quando levada ao extremo, pode realmente conduzir à felicidade ou se resulta em isolamento e destruição.

Outro tema central é a dualidade entre corpo e espírito. A recuperação física de Michel desperta nele um novo interesse pelo corpo, tanto o seu quanto o dos outros, o que o leva a explorar sua sexualidade de forma mais aberta e, eventualmente, a viver em desacordo com as normas morais tradicionais. A obra explora a tensão entre a vitalidade física e as restrições impostas pela sociedade, refletindo a própria experiência de Gide com sua sexualidade e suas crenças pessoais.